Η υπερσύγχρονη εγκατάσταση της AEGEAN στον Ασπρόπυργο συνολικής επιφάνειας 60.000 τ.μ., καλύπτει τις ανάγκες τις εταιρείας στη διανομή καυσίμων στο δίκτυό της στην Αττική καθώς και τη νότια και νησιωτική Ελλάδα. Διαθέτει 21 δεξαμενές αποθήκευσης, συνολικής χωρητικότητας 32 εκατομμυρίων λίτρων και 2 υπόγειους αγωγούς που συνδέουν απευθείας την εγκατάσταση με τα διυλιστήρια των ΕΛΠΕ στον Ασπρόπυργο, σύστημα ταυτόχρονης φόρτωσης (Bottom Loading) τεσσάρων βυτιοφόρων και πρόσβαση στη θάλασσα με προβλήτα με δυνατότητα ταυτόχρονης εξυπηρέτησης δύο δεξαμενοπλοίων.
Στην εγκατάσταση λειτουργεί επίσης εργοστάσιο παραγωγής λιπαντικών και κτήρια γραφείων συνολικής επιφάνειας 2.500 τ.μ.

Στην Αλεξανδρούπολη η εταιρεία διαθέτει σύγχρονη ιδιόκτητη εγκατάσταση αποθήκευσης και διακίνησης υγρών καυσίμων, καλύπτοντας τις ανάγκες του δικτύου της στην περιοχή της Θράκης και Ανατ. Μακεδονίας. Βρίσκεται στην παραλία Μαΐστρου σε έκταση 26.290 τμ και διαθέτει 13 δεξαμενές αποθήκευσης πετρελαιοειδών, στις οποίες έχουν πρόσβαση πλοία, τρένα και βυτιοφόρα οχήματα.